Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSRP1Q08945 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms