Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LOXL1Q08397 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms