Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms