Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms