Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOSBP53539 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOSBP53539 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOSBP53539 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms