Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK8P49336 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms