Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMD8P48556 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMD8P48556 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms