Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB2P47870 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms