Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBX2P40425 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBX2P40425 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PBX2P40425 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms