Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPA9P38646 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSPA9P38646 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms