Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms