Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms