Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms