Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CTSSP25774 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTSSP25774 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTSSP25774 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTSSP25774 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTSSP25774 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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