Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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