Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMPD1P23109 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.8 ms