Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms