Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZBED1O96006 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZBED1O96006 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZBED1O96006 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ZBED1O96006 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED1O96006 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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