Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RCBTB2O95199 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms