Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTNBO60941 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTNBO60941 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms