Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms