Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YJEFN3A6XGL0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms