Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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