Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTF2Q9UNY4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms