Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAX2Q9UIW0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms