Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CLIP2Q9UDT6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLIP2Q9UDT6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms