Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP35Q9P2H5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP35Q9P2H5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP35Q9P2H5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP35Q9P2H5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP35Q9P2H5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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