Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRBP1Q9P2E9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms