Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD5Q9P267 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms