Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXC10Q9NYD6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXC10Q9NYD6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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HOXC10Q9NYD6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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