Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms