Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms