Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms