Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF25Q9BQ70 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms