Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EP400Q96L91 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms