Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHIPQ8WWQ0 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms