Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CHD5Q8TDI0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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