Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD1Q8NHV4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms