Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms