Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms