Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms