Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RHOUQ7L0Q8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOUQ7L0Q8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms