Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A5Q71RS6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms