Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC149Q6ZUS6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms