Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms