Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms