Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPPQ6IPU0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms