Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC7AQ5VTJ3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHDC7AQ5VTJ3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms