Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC27A3Q5K4L6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms