Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IRF5-213ENST00000489702 2988 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BCO1-201ENST00000258168 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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ANKRD39Q53RE8 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC023830.2-201ENST00000563704 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NBPF4-201ENST00000415641 2485 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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ANKRD39Q53RE8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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